Давайте рассмотрим случай, как можно закачать файл какой-либо файл в корень вашего сайта, как можно получить к ним доступ в том случае, если вы используете панель управления сайтом ISP Manager. 

Предполагается, что у вас установлен веб-сервер Apache и CentOS 7. Это видео как раз для этого случая. 

После того, как вы зашли в панель управления ISPManager, переходим во вкладку Система и выбираем пункт меню "Менеджер файлов". С его помощью можно получить доступ к файлам вашего сайта. 

Давайте я покажу тот путь, где в моем случае располагаются файлы сайта. 

Переходим в папку /var/www/имя_пользователя_сайта/data/www.

В итоге, я попадаю в корневую директорию, где располагаются все файлы сайта. Теперь мы можем с помощью специальной иконки (см. видео) закачать какие-либо файлы туда. 

Если нужно закачать несколько файлов, запакуйте их в архив и закачайте на сайт архив и потом его можно с помощью специальной иконки разархивировать.

Также мы можем просматривать какие-то файлы, изменять их, менять их атрибуты, копировать и.т.д.

Вот такая техника работы.